1985年，南京農業(yè)大學(xué)就開(kāi)始招收金融學(xué)專(zhuān)業(yè)的本科生。1998年，南京農業(yè)大學(xué)獲得金融學(xué)碩士學(xué)位授予權。2002年，南京農業(yè)大學(xué)開(kāi)始招收農村金融專(zhuān)業(yè)博士生。2010年，南京農業(yè)大學(xué)獲得金融學(xué)博士學(xué)位授權點(diǎn)。

　　2006年金融學(xué)專(zhuān)業(yè)列為江蘇省品牌專(zhuān)業(yè)，2010年會(huì )計學(xué)專(zhuān)業(yè)列為江蘇省特色專(zhuān)業(yè)，2012年金融學(xué)專(zhuān)業(yè)和會(huì )計學(xué)專(zhuān)業(yè)又成為江蘇省重點(diǎn)建設專(zhuān)業(yè)，2019年金融學(xué)專(zhuān)業(yè)入選首批國家級一流本科專(zhuān)業(yè)建設點(diǎn)。

　　金融學(xué)院目前擁有金融學(xué)博士、金融學(xué)碩士、會(huì )計學(xué)碩士、金融碩士（MF）、會(huì )計碩士（MPAcc）等多層次的研究生培養體系，曾為中國農業(yè)銀行總行、中國人民銀行南京分行等舉辦金融學(xué)碩士班，為政府有關(guān)部門(mén)、銀行、保險公司、證券公司、會(huì )計師事務(wù)所等培養了眾多高層次的金融、會(huì )計和審計方面的專(zhuān)業(yè)人才。